Никакого конфликта нет. Это ошибка в модуле projects. Приведенный Вами же стек вызовов содержит ответ на Ваш вопрос :)
#1 CotDB->query(SELECT COUNT(*) FROM WHERE
Как видите между FROM и WHERE должно быть название таблицы, а его нет. Это и есть причина ошибки запроса.
Судя по всему автор Вашего модуля подставляет имя таблицы из глобальной переменной. А использовать глобальные переменные плохо (это приводит к подобным проблемам). И не проверять их существование перед использованием тоже плохо.
Ошибка возникает в файле modules/projec ts/projects.admin.home.php строка 25. Исправить можно, например объявив переменную которая там используется как глобальную.